Заново оснащенный ВПП Томск пропускает 8 чартеров в месяц.
Правительство РФ открыло аэропорт Томск /Богашево/ для выполнения международных полетов и соответствующим распоряжением установило в нем воздушный грузо-пассажирский временный многосторонний пункт пропуска через государственную границу РФ на период функционирования в Томской области особой экономической зоны /ОЭЗ/ технико-внедренческого типа в 2010 году. При этом период действия ОЭЗ продлен до 2055 года. Межведомственной комиссией пункт пропуска, после реконструкции и оснащения, принят 19 апреля 2013 года и сегодня аэропорт разивает международное сообщение: пропускная способность ВПП составляет 8 чартерных рейсов в год (Крым, Турцию, Египет, Китай, Таиланд, регулярные рейсы в Среднюю Азию, в Восточную Германию), 200 пассажиров в час на международных линиях. Общая площадь аэровокзального комплекса после реконструкции составила более 10 000 кв. м, пункта пропуска - 2 200 кв. м.